Во втором сезоне продолжается история клуба музыкального инструмента Кото, в котором всё так же главенствует президент Курата. Главный герой не планировал становиться лидером школьного сообщества, но обстоятельства вынудили его взять на себя эту роль. Клуб оказался под угрозой закрытия, и, чтобы его спасти, Курата начал активно искать новых участников, с которыми смог бы возродить сообщество. В ходе своих поисков он знакомится с Тикой — старшеклассником с грубоватым характером, который подаёт заявку на членство в клубе.
Этот поступок Тики привлекает внимание и других студентов, и в результате Курате удаётся сохранить клуб. Однако на этом его приключения не заканчиваются. Во втором сезоне ему по-прежнему предстоит управлять делами клуба и следить за его членами. Тика помогает ему в этом, хотя порой и создаёт некоторые трудности. Тем не менее, вместе они способны преодолеть все преграды. Кроме того, клубу необходимо подготовить музыкальный номер, что требует от каждого участника полной отдачи и возможности продемонстрировать свои навыки игры на Кото.