Сюжет второго сезона погружает нас в мир академии экзорцистов, где обучаются юные воины света, сражающиеся против демонов и тёмных сил. В центре событий стоит Рин Накамура, молодой и пылкий ученик, скрывающий в себе могущественную силу. Он — сын самого Повелителя Ада, что ставит его в необычное положение среди остальных учеников. После трагической гибели своего приёмного отца, Рин твёрдо решил победить Сатану и спасти мир от грядущей катастрофы. Однако дорога к этому не будет простой: его ждут испытания как со стороны демонов, так и от тех, кто призван защищать человечество. Мефистофель, загадочный и могущественный директор академии, видит в Рине не просто ученика, а ключ к победе над тьмой. Он стремится раскрыть истинную силу юноши, надеясь, что тот сможет взять верх над своим отцом. Однако Рин, несмотря на своё происхождение, не желает становиться инструментом в чьих-либо руках. Он стремится доказать, что способен контролировать свою тёмную сторону, и, несмотря на внутренние противоречия, стремится найти друзей и союзников среди своих одноклассников.
Но не всё так просто: Церковь, узнав о существовании сына Сатаны, решает вмешаться. В академию направляется опытный экзорцист, Сюра. Её задача — выяснить, насколько Рин опасен для окружающих. Встретившись с юношей, она понимает, что тот не так прост, как кажется. Его искреннее стремление к справедливости и желание защитить друзей заставляют Сюру усомниться в своём первоначальном намерении. Вместо того чтобы убить его, она решает дать Рину шанс и стать его наставницей. Сюра начинает следить за его развитием, пытаясь помочь ему сохранить человечность и не поддаться тёмным силам, которые всё сильнее манят его. Тем временем Сатана, оставаясь в тени, не теряет надежды воплотить свой коварный план и захватить тело одного из своих сыновей, чтобы разрушить мир людей.