В недалёком будущем мир погружается в хаос после таинственного повышения уровня мирового океана. Стихийная катастрофа унесла множество жизней, и лишь немногим удалось выжить, укрывшись в защищённых городах или на плавучих платформах. Главный герой, Нацуо Икаруга, пережил трагедию в детстве, лишившись ноги в результате несчастного случая. Он выбрал жизнь у моря, предпочитая solitude прибрежных земель шуму перенаселённых мегаполисов. Нацуо остался один, после смерти своих близких родственников, и его последняя надежда на будущее заключена в наследстве бабушки. Это наследство – загадочный склад, находящийся на морском дне, однако Нацуо обладает подводной лодкой, которая может помочь ему достичь цели.
Кроме того, бабушка оставила после себя обширный арсенал морского геолога, что открывает перед Нацуо новые возможности. Погружаясь в подводный склад, Нацуо неожиданно обнаруживает спящую Атори – робота, который выглядит как точная копия человека, но в её сложной конструкции скрывается нечто большее. Атори не просто умна, она может стать ключевым союзником в этом новом мире, погружённом в бескрайние морские просторы. Путешествия Нацуо и Атори обещают быть наполненными захватывающими открытиями и неожиданными испытаниями, которые изменят их судьбы и раскроют новые горизонты в этом затопленном мире.