В далеком будущем, на опустошенной Земле, где от некогда процветающей цивилизации остались лишь обугленные руины и выжженные деревья, выжившие люди существуют в условиях тотального контроля. Мир, каким он был, разрушен безжалостным вторжением инопланетных сил, стеревшим с лица планеты 90% человечества. Земля стала местом бесконечной боли и страха, где остатки населения вынуждены жить в приютах, созданных правительством. Эти заведения, больше похожие на тюрьмы, имеют единственную цель: стереть память о пережитом кошмаре, чтобы избавить выживших от невыносимого груза прошлого. Среди обитателей одного из таких приютов выделяются трое подростков, которым суждено сыграть ключевую роль в противостоянии с новым врагом. Парни избраны для участия в секретном проекте, связанном с созданием уникальных робо-машин. Эти машины не просто техника, они представляют собой живые существа с глубокой эмоциональной связью с пилотами.
Каждый пилот обязан полностью слиться с машиной, стать ее сердцем и разумом, чтобы управлять ею на пределе человеческих возможностей. Проект, в котором принимают участие подростки, направлен на создание особого боевого робота, способного объединяться с другими машинами, создавая мощного Мусаси, построенного из таинственного материала «Мегатрон». Эта структура не просто боевой аппарат, а нечто большее, обладающее силой, способной противостоять любой угрозе. Но путь к этому достижению полон испытаний: пилоты вынуждены сталкиваться с внутренними демонами, переживать болезненные трансформации и преодолевать невероятные трудности, чтобы выжить и защитить остатки человечества от новой, еще более смертоносной угрозы.